Τις ιδιαίτερες προκλήσεις της περιοχής μετά την απολιγνιτοποίηση ανέδειξε η Μερόπη Τζούφη στη συνεδρίαση της Επιτροπής Έρευνας και Τεχνολογίας της Βουλής με θέμα «Πώς ένα οικοσύστημα καινοτομίας μπορεί να αναπτύξει την Ελληνική Περιφέρεια: το παράδειγμα της Δυτικής Μακεδονίας», ενώ επέλεξε να τοποθετηθεί συνολικά για την κατάσταση της έρευνας, των πανεπιστημίων και των ερευνητικών κέντρων στη χώρα.

Η κ. Τζούφη σημείωσε ότι η Δυτική Μακεδονία αντιμετωπίζει καθημερινά την ανεργία, την κοινωνική αποδιάρθρωση και τη μετανάστευση νέων επιστημόνων. Την ίδια στιγμή, διαθέτει σημαντικά εργαλεία - Πανεπιστήμιο, νέες Σχολές και ερευνητικές Μονάδες, καθώς και ανθρώπινο δυναμικό υψηλής ποιότητας - που μπορούν να αποτελέσουν τον πυρήνα ενός οικοσυστήματος καινοτομίας και δίκαιης μετάβασης, αρκεί να υπάρξει πολιτική βούληση και σχέδιο.

Στη συνέχεια, διεύρυνε την τοποθέτησή της στη συνολική εικόνα για την έρευνα και την καινοτομία στη χώρα, κατηγορώντας την κυβέρνηση ότι απαξιώνει συστηματικά το δημόσιο πανεπιστήμιο και την ανεξάρτητη έρευνα. Ειδική αναφορά έκανε στο πρόγραμμα «Εμπιστευτείτε τα αστέρια μας», το οποίο χαρακτήρισε «φιάσκο», καθώς χαρακτηρίστηκε από έλλειψη ακαδημαϊκών κριτηρίων, υποστελέχωση και απουσία διαφάνειας.